Untuk menjalankan roda pemerintahan, berikut adalah susunan organisasi Pemerintah Desa Padi Jaya:
PJ Kepala Desa: Syarif Abu Bakar
Sekretaris Desa: Sudirman
Kaur Umum Perencanaan: Basuni
Kaur Keuangan: Syafii
Kasi Pemerintahan: Marju'i
Kasi Kespel: Hasan